2018年12月4日，教育部办公厅发布教技厅函〔2018〕126号《教育部办公厅关于公布2018年度省部共建协同创新中心认定名单的通知》,共认定了59个中心，其中，有6个中心因属于军民融合类，并未对外公布。其余53个中心分别依托于53所高校，共涉及34所入选首批“双一流”建设高校名单的高校。其中,上海有三所高校成功入选，分别是复旦大学、上海中医药大学、上海理工大学。
为持续推动高校协同创新，今年教育部启动了省部共建协同创新中心（简称“中心”）工作。中心分批次进行，4年一个周期，原则上每年组织认定一次，以解决重大需求的贡献度为认定标准。认定程序采取省级推荐、部级认定的方式进行。今年认定的中心建设期为2019-2022年，由省、部共同支撑建设、运行。教育部要求，各地在中心建设周期内，要对获得最终认定的中心加大资金资助额度，并连续给予4年专项资金资助。教育部则将在繁荣计划、科研项目组织、科研基地建设、招生计划等方面，对中心优先考虑、统筹支持。此外，有关省级教育行政部门还应督促中心在每年12月15日前向教育部报送年度报告，4年期满后，中心将接受第三方评估。
上海高校入选首批省部共建协同创新中心认定名单（不含军民融合类） | ||
序号 | 中心名称 | 依托高校 |
1 | 上海中医药慢性病防治与健康服务省部共建协同创新中心 | 上海中医药大学 |
2 | 长三角集成电路设计与制造省部共建协同创新中心 | 复旦大学 |
3 | 上海太赫兹破普与影像技术省部共建协同创新中心 | 上海理工大学 |